Este o afecţiune virală, care se manifestă prin apariţia unei erupţii tip veziculare la nivelul mucoasei bucale. Veziculele ulcerează foarte rapid, iar ulceraţiile sunt extrem de dureroase, împiedicând alimentarea şi chiar vorbirea. Evoluţia este de 7-10 zile, indiferent de tratament (ca la orice infecţie virală).
Prezenţa stomatitei aftoase semnalizează o scădere a imunităţii organismului şi în special, o carenţă a apărării mucoasei digestive şi respiratorii. De cele mai multe ori apare într-un context de oboseală intensă a organismului sau după administrarea unor medicamente cu acţiune toxică hepatică, în paralel cu ingerarea unor alimente lipsite de substanţele nutritive necesare (alimente prea prelucrate termic, congelate, la cuptor etc).